Ressource pédagogique · Non dispositif médical · Ne remplace pas le jugement clinique

Infections urinaires (cystite / pyélonéphrite)

Infection bactérienne du tractus urinaire : cystite (bas appareil) ou pyélonéphrite (haut appareil, parenchyme rénal). Urgence si forme compliquée ou gravité.

Épidémiologie

Infections les plus fréquentes après les infections respiratoires. Femme >> homme (anatomie). Chez l'adulte (SPILF 2015) : E. coli est responsable de 90 % des IU communautaires ; dans les IU associées aux soins, il est largement majoritaire, avec des fréquences variant selon les études de 26 à 46,2 %.

Agents fréquemment associés

Associations pédagogiques — non exhaustives — à nuancer selon le terrain et le contexte

• Escherichia coli — très fréquent (Adulte : 90 % des IU communautaires ; 26 à 46,2 % des IU associées aux soins selon les études (SPILF 2015))
• Klebsiella pneumoniae — fréquent (IU associées aux soins de l'adulte : 7,7 à 10 % des micro-organismes selon les études (SPILF 2015). K. pneumoniae urinaires producteurs de BLSE en France en 2024 (mission PRIMO) : 7,9 % chez les patients vivant à domicile, 20,0 % chez les résidents d'Ehpad (Santé publique France 2026))
• Enterococcus faecalis / faecium — fréquent (IU associées aux soins de l'adulte : 7,5 à 21 % des micro-organismes selon les études (SPILF 2015))
• Pseudomonas aeruginosa — occasionnel (Rarement responsable d'IU communautaires ; IU associées aux soins de l'adulte : 4,1 à 25 % des micro-organismes selon les études, 10,5 % avec sonde urinaire à demeure contre 4,1 % sans dans l'une d'elles (SPILF 2015))
• Enterobacter cloacae complex / Klebsiella aerogenes (ex-E. aerogenes) — occasionnel (IU associées aux soins de l'adulte : 2,5 à 5 % des micro-organismes dans les études qui le précisent (SPILF 2015))
• Proteus mirabilis — occasionnel (Lithiases urinaires (uréase ++))
• Streptococcus agalactiae — rare (Grossesse, sujet âgé)
• Candida spp. — rare (Sonde vésicale, diabète, réanimation. IU associées aux soins de l'adulte : 2,6 à 21 % des micro-organismes selon les études, 13,9 % en réanimation (SPILF 2015))

Point diagnostique clé

ECBU recommandé pour toute pyélonéphrite/IU compliquée — interprétation : leucocyturie > 10⁴/mL + bactériurie ≥ 10³ UFC/mL pour E. coli ou S. saprophyticus (≥ 10⁴ pour les autres espèces chez la femme). BU suffisante pour cystite simple de la femme jeune. Hémocultures si fièvre > 39°C ou tableau sévère. Échographie rénale (obstacle?) en urgence si colique néphrétique fébrile.

Sources

• SPILF 2015 — IU communautaires de l'adulte (actualisation ; Caron F et al., Méd Mal Infect 2018)
• SPILF/AFU/SF2H 2015 — Infections urinaires associées aux soins (IUAS) de l'adulte (RPC, version finale du 7 mai 2015)
• Santé publique France / Mission PRIMO — Résistance bactérienne en soins de ville et en Ehpad, résultats 2024 (avril 2026)
• IDSA UTI Guidelines 2011 (Gupta K et al., Clin Infect Dis)

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